注册公司后申请发票的流程通常涉及以下几个步骤：

税务登记：在公司注册完成后，首先需要到税务局进行税务登记，确定税种、税率等信息。现在大多数地区已经实现了工商注册与税务登记的联动，企业注册成功后，相关信息会自动推送到税务部门，但还是需要去税务局确认并激活。
领取税控设备：根据国家规定，企业需要使用税控设备开具增值税专用发票或普通发票。你需要向主管税务机关申请购买税控盘或者金税盘等税控设备，并安装相关开票软件。
发票种类选择：根据你的业务需求决定申请哪种类型的发票。一般分为增值税专用发票和增值税普通发票。如果你的客户需要进项税额抵扣，则需开具增值税专用发票；如果是面向最终消费者，则可以开具普通发票。
发票核定：向税务机关提交发票申请，包括发票的种类、限额及数量等信息。税务机关会根据企业的实际情况进行审核，并核定你可以开具的发票类型、限额和数量。
领取发票：审批通过后，你可以到税务机关领取纸质发票，或者申请电子发票。近年来，电子发票越来越普及，它不仅环保而且管理更加方便。
学习如何正确开具发票：获得发票后，需要按照相关规定正确填写发票内容。如果不确定如何操作，可以参加税务局组织的相关培训或查阅官方指南。
合规保存记录：确保所有发票的存根联和记账联都得到妥善保管，以便日后查验和审计。
请注意，不同地区的具体流程可能略有差异，建议咨询当地税务机关获取最准确的信息。此外，随着数字化的发展，很多步骤都可以在网上完成，大大提高了效率。