医疗机构提供的“免费体检”收入在税务处理中可能被认定为视同销售，需根据具体情形和税法规定进行增值税和企业所得税的处理。以下是关键要点分析：
一、增值税视同销售的情形
政策依据
根据《营业税改征增值税试点实施办法》（财税〔2016〕36号附件1）第十四条，单位或个体工商户向其他单位或个人无偿提供服务（用于公益事业或以社会公众为对象的除外），视同销售服务，需缴纳增值税。
具体判定
公益性质免费体检：若体检面向社会公众（如社区健康普查、政府委托项目），通常不视同销售，无需缴纳增值税。
非公益性质免费体检： 例如：企业向特定客户或员工提供的免费体检，可能被认定为市场推广或职工福利，需按同类服务价格计算销项税额。
若无同类价格，按组成计税价格（成本×（1+成本利润率））确定销售额。
发票开具
视同销售时需开具增值税普通发票（无需向个人开具专用发票），申报未开票收入。
二、企业所得税视同销售的处理
政策依据
《企业所得税法实施条例》第二十五条规定，企业将货物、财产、劳务用于捐赠、赞助、职工福利等用途，应视同销售确认收入。
收入确认标准
按体检服务的公允价值（市场价）确认收入，同时相应支出（如体检成本）可税前扣除。
例外：符合公益性捐赠条件的支出（如通过公益性社会组织或县级以上政府），在利润总额12%以内可扣除。
三、关键注意事项
区分用途与对象
明确免费体检属于公益行为还是商业行为（如客户维护、员工福利），公益性质通常可免税。
留存证明材料
保留体检项目明细、成本凭证、服务对象证明（如社区活动通知、合作协议等），以佐证公益性。
地方政策差异
部分地区可能对非营利性医疗机构的免税范围有细化规定，需咨询主管税务机关。
四、建议操作步骤
自查服务性质：判断是否属于税法规定的公益行为。
核定公允价值：参考同类体检服务市场价格。
税务申报： 增值税：在《增值税申报表》中填报视同销售额（未开票收入栏次）。
企业所得税：在《纳税调整项目表》中调整视同销售收入及成本。
咨询专业人士：若存在复杂情形（如混合经营），建议委托税务师协助。
总结：医疗机构免费体检是否视同销售，核心在于服务目的和对象。公益性质通常免税，而商业用途需按公允价值计税。合规留存资料并主动沟通税务机关，可有效降低税务风险。